El restaurante cuenta con huerta propia donde se cultivan diversos productos (dependiendo de la temporada) que luego se servirán en la mesa. Todos los días, el propio Jose Mari junto a su mujer e hijo, se encargan de mimar las lechugas, pimientos, tomates....
Además Bedua ofrece la posibilidad a los clientes de poder comprar las verduras que en dicha huerta se cultivan. Tanto es así, que el cliente antes de disponerse a comer en el asador puede acercarse a la huerta situada a pocos metros del restaurante y se le enseñará los productos que en ella se cultivan.
Para acceder a ella, es necesario pasar por un puente de estilo romano, ya que la huerta está ubicada sobre una isla.
En primavera el cultivo de la huerta arranca con guisantes, habas, lechugas y cebolletas para más tarde incorporar los tomates, pimientos verdes, vainas, acelgas, puerros, zanahorias y patatas que son utilizados para elaborar el panaché que se sirve durante todo el año.
Todo lo que en la huerta se trabaja sirve para dar a sus platos el inconfundible sabor de la comida tradicional vasca.